Na ostrvu se nalazi 16 od 1300 vrsta biljaka koje rastu samo Grčkoj. Od tih 16 biljnih vrsta 5 su proglašene retkim. Jugoistočni deo ostrva Kea je uvršćen u mrežu Νatura 2000. Jedinstvene divlje orhideje, farmaceutske biljke, aromatično žbunje, retke pečurke, raznobojni lišajevi, visegodisnji kesteni, javori, divlje ruže, mak, zumbuli, divlje gladiole i druge, čine jdinstvenu kombinaciju boja i mirisa i opčinjavaju posetioce i ljubitelje prirode. Obale prave male zalive, rtove i morske pećine. Najveći zaliv je zaliv Sv. Nikole koji je od najvećih prirodnih luka na Sredozemlju. Malo istočnije od njega je zaliv Ocia otvoren ka severu. Na jugozapadu je zaliv Kunduros, uvala Poles i Spati na istoku a na zapadu Pises. Morsko dno je ukrašeno velikim površinama pod biljnim svetom.